Сейчас Минюст, принимая решение о ликвидации колоний или изменении их вида, должен согласовать его с органами исполнительной власти в том регионе, где находится учреждение. В то же время закон не регулирует порядок реализации Минюстом своих полномочий в случае, если региональные власти своего согласия не дадут.
Подписанный президентом Путиным закон передает полномочия по принятию таких решений правительству — но только в случае, если Минюст и региональные исполнительные власти не смогут прийти к согласию.
По действующему законодательству, ликвидации подлежат исправительные учреждения со значительным износом основных фондов, отсутствием базы для трудоустройства осужденных, находящиеся в зонах подтопления, а также расположенные далеко от областных центров, если нет необходимых условий для содержания осужденных и проживания работников уголовно-исполнительной системы. С 2011 года в России ликвидировали порядка ста исправительных учреждений.