В Арбитражный суд Москвы поданы два иска от ОАО "Альфа-банк" к ОАО "Байкальский целлюлозно-бумажный комбинат" (БЦБК) на сумму около 30 миллионов рублей. Предмет одного из исков о неисполнении обязательств по договорам на сумму 27,6 миллиона рублей. Второй иск банк подал на сумму два миллиона рублей, спор также касается неисполнения обязательств по договорам по кредиту. Иски зарегистрированы 28 января 2009 года, дата рассмотрения пока не назначена.
В настоящее время Четвертый арбитражный апелляционный суд в Чите рассматривает жалобу управления Росприроднадзора по Иркутской области на решение суда об отказе в удовлетворении иска о взыскании с Байкальского ЦБК 419,7 миллиона рублей ущерба, нанесенного озеру Байкал. Кроме того, 3 ноября 2007 года закончился срок действия лицензии на водопользование и других документов, выданных Байкальскому ЦБК. С этого момента предприятие осуществляет не разрешенный в установленном порядке сброс технологических отходов и стоков в озеро Байкал.
Также, в ноябре 2008 года руководство Байкальского ЦБК заявило о том, что комбинат приостанавливает работу до 10 февраля 2009 года и начинает консервацию производственных мощностей, в связи с чем должны были быть уволены почти полторы тысячи работников предприятия.
