24 июля 2017 года банк подал иск в АСГМ (дело № А40-164459/2017) и попытался признать действия Центробанка об отзыве и введении временной администрации незаконными. Однако во всех трех инстанциях суд признал действия Банка России законными. 26 октября 2018 года банк «Югра» обратился с кассационной жалобой в Верховный суд, но процессуальное решение о передаче или об отказе в передаче дела на рассмотрение пока не принято.
На момент отзыва лицензии банк занимал 33-ю строчку по размеру активов, а выплаты вкладчикам банка превысили 173 млрд руб. В сентябре АСГМ признал банк «Югра» банкротом и открыл в отношении кредитной организации конкурсное производство сроком на один год (дело № А40-145500/2017).