Ампилогова обвиняется в совершении преступления, предусмотренного частью 3 статьи 160 УК РФ ("Присвоение или растрата чужого имущества с использованием своего служебного положения"). Санкция данной статьи предусматривает максимальное наказание до десяти лет лишения свободы с конфискацией имущества.
В ходе предварительного следствия установлено, что Елена Ампилогова, вступив в сговор с главным бухгалтером Надеждой Дамбаевой и бухгалтером Мариной Пашниной, похищали деньги, перечисляя их на пластиковые карты — личные и своих близких. Похищенные деньги тратили на заграничные поездки, приобретение автомашин и квартир.
Подельницы Ампилоговой — Пашнина и Дамбаева приговором Магаданского городского суда ранее были осуждены. Самой Ампилоговой удалось скрыться и в течение нескольких месяцев скрываться от следствия.