Маркин работал в СК с самого основания. В 2007-м пришел в пятидесятилетнем возрасте по личному приглашению Александра Бастрыкина. До этого был радиоведущим, телепродюсером.
С 13 сентября 2007 по 20 июня 2011 года Владимир Маркин возглавлял управление взаимодействия со средствами массовой информации Следственного комитета, тогда еще при прокуратуре Российской Федерации.
С 20 июня 2011 года по 6 октября 2016 года был официальным представителем СКР.
Маркин запомнился яркими комментариями о работе и инициативах Следственного комитета. После ухода Маркина СМИ признавали, что он поднял планку пресс-службы силовой структуры на недосягаемую высоту.